Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATG3Q9NT62 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATG3Q9NT62 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms