Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBQLN4Q9NRR5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBQLN4Q9NRR5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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