Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ASCL3Q9NQ33 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms