Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A4GALTQ9NPC4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms