Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GOPCQ9HD26 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GOPCQ9HD26 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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