Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPJQ9HC77 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPJQ9HC77 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms