Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMURF2Q9HAU4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms