Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NRDE2Q9H7Z3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NRDE2Q9H7Z3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms