Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CEP44Q9C0F1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CEP44Q9C0F1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms