Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms