Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYCP2Q9BX26 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYCP2Q9BX26 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms