Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNB1Q9BVA0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNB1Q9BVA0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms