Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf16Q9BUW7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms