Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BPIFA3Q9BQP9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms