Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SGIP1Q9BQI5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms