Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CRBNQ96SW2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms