Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC38A2Q96QD8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms