Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CAPNS2Q96L46 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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