Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
BORCS6Q96GS4 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BORCS6Q96GS4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms