Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAF2Q96CS3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms