Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EME1Q96AY2 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms