Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
UBE2E3Q969T4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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UBE2E3Q969T4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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UBE2E3Q969T4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBE2E3Q969T4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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