Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HLA-CQ95604 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms