Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TM9SF4Q92544 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TM9SF4Q92544 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms