Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
C11orf40Q8WZ69 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms