Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GIPC3Q8TF64 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms