Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NEDD1Q8NHV4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms