Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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