Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3C3Q8NEB9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIK3C3Q8NEB9 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms