Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FAM71DQ8N9W8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FAM71DQ8N9W8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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