Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LNX2Q8N448 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LNX2Q8N448 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms