Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms