Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC84Q86UT8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms