Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
WDR53Q7Z5U6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms