Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APTXQ7Z2E3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms