Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BHLHA9Q7RTU4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms