Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XIRP1Q702N8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XIRP1Q702N8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms