Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LETMD1Q6P1Q0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms