Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NANOGP8Q6NSW7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms