Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GARNL3Q5VVW2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GARNL3Q5VVW2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms