Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HES3Q5TGS1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HES3Q5TGS1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms