Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FRMPD1Q5SYB0 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms