Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms