Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC93Q567U6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms