Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDLIM3Q53GG5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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