Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RFTN2Q52LD8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms