Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC39A12Q504Y0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms