Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CTXN3Q4LDR2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTXN3Q4LDR2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms