Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms