Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RRN3P1Q2M238 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
RRN3P1Q2M238 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms